办理日本签证主要有以下几种情况，每种情况的办理流程会有所不同：
旅游签证：
确定签证类型：日本旅游签证有单次签证、多次签证等类型。单次签证有效期一般为 90 天，可在日本停留 15 天；多次签证有效期有 3 年或 5 年，每次停留时间不等。根据自己的旅行计划确定申请的签证类型。
准备材料：
基础材料：有效护照（有效期需在 6 个月以上，并且有足够的空白签证页）、签证申请表（可在日本使领馆官网下载或通过代办机构获取）、近期免冠照片（尺寸一般为 4.5cm×4.5cm 的白底彩照）、户口本复印件等。
经济材料：根据个人情况提供相应的经济能力证明。例如，年收入 10 万以上的在职证明（需同时盖有公司公章及负责人签名）、近三个月的工资流水、银行存款证明（一般建议 5 万以上存款）等；退休人员提供退休证及退休金流水；学生可提供父母的经济支持证明等。
行程材料：往返机票预订信息、酒店预订信息、详细的行程计划等。
选择申请途径：日本驻华领事馆及大使馆不接受个人直接递签，必须由领馆认可的旅行社、签证代理机构帮忙提交申请。您可以通过网络搜索、朋友推荐等方式选择可靠的代办机构，并向其咨询具体的办理要求和流程。
递交申请并缴费：将准备好的申请材料递交给所选的代办机构，同时缴纳签证申请费用。单次入境签证费用一般为 200 元人民币。
等待审批：提交申请后，需要等待日本使领馆进行审批。一般情况下，办理时间为 5 至 10 个工作日，但在旅游旺季或申请人数较多时，审批时间可能会延长。
领取签证：如果签证申请获得批准，您可以根据代办机构的通知，前往指定地点领取护照及签证，或者选择通过邮寄方式收到护照及签证。
商务签证：
准备材料：
日方邀请单位出具的招聘理由书、身元保证书、滞在日程表（需有每天活动安排及联系人电话、住宿酒店名称及电话）等。
中方公司的营业执照复印件、派遣函、申请人的在职证明等。
护照、签证申请表、照片、户口本复印件等基础材料。
申请流程：与旅游签证类似，通过代办机构向日本使领馆提交申请，缴纳费用，等待审批和领取签证。商务签证的办理时间可能会因具体情况而有所不同。
留学签证：
获得在留资格认定证明书：首先需要被日本的学校录取，学校会为学生向日本法务省入境管理局申请 “在留资格认定证明书”。
选择代办机构：登录日本国驻华大使馆官网，根据自己的户口所在地找到归属的领事馆，然后在该领事馆的官网找到指定的代办机构。留学签证不接受个人递签，必须通过官方指定的代办机构办理。
准备材料并提交：按照代办机构的要求准备材料，一般包括护照、在留资格认定证明书原件及复印件、签证申请表、照片、户口本复印件、留学调查表、经费支付人的在职证明、毕业证复印件或毕业证明等。
等待审批和领取签证：提交申请后等待日本使领馆审批，审批通过后领取签证。留学签证的办理时间相对较长，建议提前准备并申请。
探亲访友签证：
准备材料：
邀请人出具的邀请函（需注明邀请目的、邀请人与被邀请人的关系、在日停留时间等）、邀请人的身份证明（如在留卡、护照等）。
亲属关系证明（如户口本、公证书等）。
申请人的护照、签证申请表、照片、户口本复印件等基础材料，以及经济能力证明等。
申请流程：通过代办机构提交申请，等待审批和领取签证。