船舶电子签证办理主要有以下步骤：
注册账号：
选择注册平台：进入 “海事船舶进出港报告服务网”（网址可能因地区或政策调整而有所不同）。部分地区也有专门的船舶电子签证手机应用程序可供下载注册。
填写信息：注册时，准确填写船名、船舶识别号、船舶移动业务识别码（MMSI 码）、联系人姓名和手机号码、船舶营运证（非营运船舶不需要）等相关信息。其中，手机号码为接收业务办理信息提示及验证的唯一途径，务必填写准确且不要随意更换。
完成注册：勾选 “我已阅读并同意” 相关的使用条款等内容，点击立即注册，即可完成电子签证注册。
申报签证：
登录系统：使用注册好的账号和密码登录电子签证申报系统。
填写申报信息：按规定填写并提交船舶动态、货物装载、在船人员、规费缴纳等相关信息。要确保所填信息真实、准确、完整。
选择签证类型：根据船舶的航行计划和需求，选择进港签证或出港签证。进港签证和出港签证不可同时办理。
进港签证：申请人应当在船舶计划靠泊或者抵达作业点 4 小时前申请办理进港签证，但提前时间不应超过 24 小时。如果航程时间不足 4 小时的，应当在离泊或驶离作业点后立即申请拟抵达港口的进港电子签证。
出港签证：船舶抵港后，申请人应当在船舶离泊或者驶离作业点 4 小时前申请办理出港电子签证，但提前时间不应超过 24 小时。船舶在港时间不足 4 小时的，应当在办妥进港签证后立即申请出港电子签证。
等待审批：
船舶提交电子签证申请后，海事部门会对申请进行审批。审批时间通常较短，但具体时长可能因地区、申请量等因素有所不同。在此期间，船长应随即通过甚高频报告船籍港海事处。
申请人可以通过申报系统查询申请进度，系统也会将审批结果自动反馈给申请人。如果电子签证申请通过，系统会发送相关的通知或审批单号；如果申请不予受理或审批不通过，船舶则需要申请窗口签证。
记录与存档：
海事部门审批完成后，船方要将船舶动态、货物装卸、在船人员等信息，以及审批结果和审批单号，准确记录在船舶签证簿中。船舶签证簿的记录将作为现场检查的证据。
需要注意的是，不同地区的船舶电子签证办理流程可能会略有差异，具体办理前可查阅当地海事部门的相关规定或咨询当地海事签证点。