汽修店办理发票有自行开票和申请代开发票两种方式，以下是具体内容：
自行开票
办理税务登记：携带营业执照、法定代表人身份证等材料到当地税务机关办理税务登记，税务机关审核通过后会核发税务登记证。
申请发票领用：持税务登记证件、经办人身份证明等材料向主管税务机关办理发票领用手续，税务机关会根据汽修店的经营范围和经营规模，核定发票的种类、数量和开票限额等。
购置开票设备和软件：根据税务机关的要求，购置符合规定的开票设备，如针式打印机等，并安装相应的开票软件。
开具发票：在提供维修服务并收取款项后，根据客户需求，登录开票软件，选择增值税普通发票或增值税专用发票，填写发票信息，包括公司名称、地址、电话、纳税人识别号、开户行及账号等，以及购买方信息、商品或服务名称、数量、单价、金额等，核对无误后点击 “开具” 按钮，然后将发票打印出来，并加盖发票专用章。
申请代开发票
准备资料：准备好税务登记证、身份证、付款方出具的付款证明以及双方签订的维修合同等资料。
提出申请：向税务机关提出代开发票申请，填写《代开发票申请表》，并提交相关资料。
审核资料：税务机关对提交的资料进行审核，审核通过后，按照规定的税率计算应纳税额，并收取税款。
开具发票：税务机关为汽修店代开发票，将发票交给汽修店，汽修店再将发票交给客户。
在办理发票时，汽修店需要确保发票信息准确无误，遵守发票开具时间规定，不得提前或延期开具，如有特殊情况，需及时联系税务机关处理。同时，要妥善保存发票存根和相关资料，以备税务机关检查。